我國科學(xué)家開發(fā)出葉綠體基因組綜合數(shù)據(jù)庫

葉綠體是植物將光能轉(zhuǎn)化為化學(xué)能的重要細(xì)胞器，具有獨(dú)立的基因組，隨著基因測序技術(shù)的發(fā)展，盡管已發(fā)布了海量的植物葉綠體基因組序列，但如何整合應(yīng)用這些數(shù)據(jù)目前仍面臨數(shù)據(jù)命名標(biāo)準(zhǔn)不統(tǒng)一、數(shù)據(jù)信息不全以及較高經(jīng)濟(jì)價值的物種尚未進(jìn)行測序等問題。

近日，發(fā)表在《Plant Biotechnology Journal》上題為“Towards comprehensive integration and curation of chloroplast genomes”的研究中，中國科學(xué)院北京基因組研究所和中國中醫(yī)科學(xué)院中藥資源中心研究人員開發(fā)了迄今為止物種數(shù)量最多的葉綠體基因組綜合數(shù)據(jù)庫Chloroplast Genome Information Resource（CGIR）。該數(shù)據(jù)庫收錄了來自11,946個物種的19,388條葉綠體基因組序列，包括利用全國第四次中藥資源普查標(biāo)本自測的718種未發(fā)表的葉綠體基因組序列，按照基因組、基因、微衛(wèi)星序列、DNA條形碼、DNA特征序列五個功能模塊對數(shù)據(jù)進(jìn)行組織與管理。

CGIR數(shù)據(jù)庫通過自主測序、整合公開基因組資源和人工數(shù)據(jù)審編向用戶提供了目前最全面、物種數(shù)量最多的葉綠體基因組數(shù)據(jù)。經(jīng)審編的物種分類、物種功能、基因名稱與序列、分子標(biāo)記等保證了數(shù)據(jù)的高度可靠，對植物系統(tǒng)發(fā)育、物種鑒定、葉綠體基因工程的發(fā)展均具有重要意義。

論文鏈接：

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36069606/

注：此研究成果摘自《Plant Biotechnology Journal》，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場，僅供參考。

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