科學(xué)家系統(tǒng)重建小鼠整個(gè)胚胎發(fā)育的細(xì)胞軌跡

哺乳動(dòng)物胚胎發(fā)育的特點(diǎn)是細(xì)胞快速增殖和多樣化。在幾周內(nèi)，一個(gè)單細(xì)胞就能分裂成數(shù)以百萬計(jì)的細(xì)胞，并生成各種各樣的功能分子。盡管哺乳動(dòng)物體內(nèi)發(fā)育的主要構(gòu)成細(xì)胞軌跡已有大量研究，但對(duì)該過程進(jìn)行全面描述仍然難以實(shí)現(xiàn)。美國華盛頓大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)提出了系統(tǒng)重建小鼠整個(gè)胚胎發(fā)育的細(xì)胞軌跡。該研究結(jié)果于近日發(fā)表在《Nature Genetics》上，題為：Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis。

研究人員整合了幾個(gè)單細(xì)胞RNA測序數(shù)據(jù)集，這些數(shù)據(jù)集覆蓋了小鼠的胃腸發(fā)育和器官形成過程，并補(bǔ)充了來自胚胎大約第8.5天的約15萬個(gè)細(xì)胞核的分析數(shù)據(jù)?？偟膩碚f，研究人員定義了從胚胎第3.5天到第13.5天連續(xù)19個(gè)階段的細(xì)胞狀態(tài)，并將它們與可能的祖先和后代建立聯(lián)系。該過程通過自動(dòng)化程序構(gòu)建。盡管如此，由此產(chǎn)生的有向無環(huán)圖（trajectories of mammalian embryogenesis，哺乳動(dòng)物胚胎發(fā)育的軌跡）與現(xiàn)在對(duì)哺乳動(dòng)物發(fā)育的理解認(rèn)識(shí)一致。

綜上所述，研究人員利用TOME系統(tǒng)地篩選出一些轉(zhuǎn)錄因子作為每種細(xì)胞發(fā)育的候選調(diào)控因子，為胚胎發(fā)育的研究提供了新思路。

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41588-022-01018-x

注：此研究成果摘自《Nature Genetics》雜志，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場，僅供參考。

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