類器官模型正在成為人生理學(xué)和病理生理學(xué)研究的重要系統(tǒng)。然而，目前該領(lǐng)域仍缺乏綜合的實驗與計算方法來對類器官的發(fā)育進(jìn)行跨空間及時間尺度的表征測量。瑞士巴塞爾羅氏創(chuàng)新中心人類生物學(xué)研究所等機(jī)構(gòu)分析研究了人視網(wǎng)膜類器官發(fā)育的多模態(tài)時空表型。該研究成果于近日發(fā)表在《Nature Biotechnology》雜志上，題為：Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development。
研究人員開發(fā)了一種分析細(xì)胞及組分的新方法，稱為迭代間接免疫熒光成像（iterative indirect immunofluorescence imaging, 4i）。他們證明了該方法能夠解析細(xì)胞類型、形態(tài)結(jié)構(gòu)、細(xì)胞器和蛋白質(zhì)定位，進(jìn)而可以分析基因表達(dá)以外的空間特征。他們將該方法應(yīng)用于人視網(wǎng)膜類器官生成了多模態(tài)圖譜，描述了整個39周視網(wǎng)膜類器官的發(fā)育。結(jié)合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和染色質(zhì)可及性時間序列數(shù)據(jù)集，推斷出類器官發(fā)育的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
該研究顯示，在發(fā)育中的類器官組織上進(jìn)行4i分析是一種具有高分辨率、有效及可重復(fù)的方法。該方法可用于對細(xì)胞樣本和規(guī)模的異質(zhì)性進(jìn)行分析。
注：此研究成果摘自《Nature Biotechnology》雜志，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場，僅供參考。
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